Blue Seed es una historia llena de referencias y nombres mitológicos (en Japón). Tanto que incluso algunos japoneses tienen dificultad en seguir determinados aspectos de la serie.

Pero bueno, la serie está basada en una leyenda, la del dios "Susanoo Wo Mikoto", una deidad japonesa salvaje que rescató a la princesa "Kusanade Hime" de ser devorada por el monstruo "Yamato no Orochi" mediante un expeditivo y poco heroico método, primero lo emborracha y después le corta sus ocho cabezas. Obviamente (y como no podía ser de otra forma) se casó con la princesa a la que rescató y tuvieron varios hijos (y esa es otra historia).

Pero antes de todo esto, este dios es responsable de la desaparición de la diosa "Amaterasu", y aunque no tiene mucha relación con la serie, es un mito muy conocido y relacionado con "la desaparición del sol" que es un mito en otras culturas.

Ya volviendo a la historia, la protagonista se llama "Fujimiya Momiji". Una joven de quince años, (mmm ... ) bastante normal, excepto por el hecho de que, desde que su hermana gemela desapareció en extrañas circunstancias, queda bajo la protección del gobierno japonés, ya que pertenece al linaje de los "Kushinada" (o Kusanade), quienes son capaces de detener y destruir a unos monstruos llamados "Aragami" con su sangre. En otras palabras y en circunstancias extremas, su sacrificio podría destruirlos.

Ella también está bajo la protección de un Aragami bastante particular, llamado "Mamoru Kusanagi". Quien (una vez en otros tiempos) era un humano, pero no uno cualquiera, sino un "Yamato no Orochi", que mató a sus padres y puso en su cuerpo siete "Mitama" condenándolo a ser el guardián de la estirpe de los Kushinada.

[NOTA.- "Mamoru" significa "protector", mientras que "Kusanagi" es el nombre de la espada del dios Susano. Por último las "mitama" son una especie de abalorios en forma de "6" (o de "9" si lo prefieres) hechos generalmente de piedra verde o azul. Su utilidad real se desconoce, ya que se suelen encontrar en yacimientos prehistóricos.
En la serie se supone que son el "alma" de los "Aragami", de ahí el nombrecito "semilla azul", ya que se supone que las "mitama" son semillas de monstruos (si viste o vieron "Earth Girl Arjuna" recordarás una de estas en la frente de la protagonista)].

En fin, para no complicarnos la vida, aparecen los "Aragami" que intentan acabar con Momiji. Ellos han descubierto que si muere en determinadas circunstancias, su muerte no los destruirá, de manera que, para asegurar su supervivencia, la atacan. Será puesta bajo la protección de una agencia especial llamada "TAC" (Terrestrial Administration Center) [Original, no creen?], un grupo que tiene desde un genio debilucho de las computadoras hasta una fanática de las armas.

La historia es (un poco) compleja, pero interesante y se desarrolla en 26 episodios con un guión (mmm ... sinceramente) original que nos lleva hasta un interesante final.