La historia empieza narrando la historia de dos hermanos, Alphonse y Edward Elric. Desde que ellos eran muy jóvenes practicaron la ciencia de la alquimia. Como habrán podido deducir, la trama en general tratará sobre la vía que siguen ellos para convertirse en alquimistas y todas las cosas que harán para recobrar lo que perdieron. Su padre era un alquimista muy reconocido, y probablemente es de ahí que vienen sus habilidades en el arte de la alquimia. Sin embargo, cuando ellos eran niños su padre se fue, dejando tanto a Alphonse como a Edward solos con su madre. En un día trágico (muy lamentable u_u) su madre murió, y en su inocencia e ignorancia, ellos intentan lo que está prohibido : "la alquimia humana".